Fiche de MONCHAUD David

MONCHAUD David
Adresse : ICMUB Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne
Bât. MIRANDE - Aille B - Bureau B-R16
9 Avenue Alain Savary
21000 Dijon – France
Tél : (+33) 380 399 043
E-mail : david.monchaud@cnrs.fr
Equipe : SMol
Statut : Directeur de recherche CNRS
Tags : Chimie Biologie, Imagerie Moléculaire, Photophysique, Chimie de Synthèse
ORCID : 0000-0002-3056-9295
Scopus Author ID : 6506084183
  • Carrière
  • Projet
  • Publications
  • Communications
  • Enseignement et Administration
Carrière

2017 : Directeur de Recherche CNRS (DR CNRS), ICMUB, CNRS UMR6302, Université de Bourgogne (Dijon, France).

2011 : Habilitation à Diriger des Recherches (HDR), ICMUB, CNRS UMR5260, Université de Bourgogne (Dijon, France).

2009 : Chercheur CNRS (CR), ICMUB, CNRS UMR5260, Université de Bourgogne. Lab of Pr. Franck Denat (Dijon, France).

2007 : Chercheur CNRS (CR), Curie Institute, CNRS UMR176. Lab of Dr. Marie-Paule Teulade-Fichou (Orsay, France).

2005 : Chercheur CNRS (CR), Collège de France, CNRS UPR285. Lab of Prof. Jean-Marie Lehn & Dr. M.-P. Teulade-Fichou (Paris, France).

2004 : Stage Post-doctoral (CNRS – Sanofi-Aventis), Collège de France. Lab of Prof. J.-M. Lehn, Dr. M.-P. Teulade-Fichou and Patrick Mailliet (Paris, France)

2003 : Stage Post-doctoral PharmaLEADS (Paris, France).

2002: Thèse en Chimie, Université de Geneve. Lab of Prof. Jérôme Lacour (Geneva, Switzerland).

Projet

2023-26: Pediatric Osteosarcoma (Resp. scientifique; Coordinateur: PI: V. Géli, CRCM FR). Ligue contre le Cancer

2022-25: InJUNCTION: Chemical tools for investigating DNA junctions (Coordinateur). ANR

2022-25: G4s in Stress Granules: Co-coordinateur avec Eran Hornstein (Dpt. of Molecular Genetics, Rehovot, IS). WIS/CNRS grant, CNRS MITI.

2021-23: ANASTASIA: Alternative nucleic acid structures stabilization triggers replicative stress and induce apoptosis (Coordinateur). ISITE BFC (UB21018.MUB.IS)

2020-24: G4s in NVUs: G4-DNA as senescence markers in the neurovascular unit (Resp. scientifique; Coordinateur: A. S. Tsvetkov, UThealth, TX USA). NIH (NIH R01 PAR-19-070)

2019-22: SEQUENTIA: Sequencing technologies adapted to the study of dementia (Coordinateur). FEDER-FSE Bourgogne 2014-2020.

2019-21 : ANASTOMOSIS: Alternative Nucleic Acid Structures as Targets for Organic Molecules to Orchestrate Sustained genomic Instability and cellular Stress (Coordinateur). Plan Cancer 2014-2020 INSERM.

2019-21 : CoolCat: Constrained oligonucleotide-based catalysts (Responsable scientifique sous-projet). ANR (ANR-18-CE07-0017-03).

2018-20 : DEMENTIA: Exploiting genetic biomarkers of neurodegenerative diseases for developing early diagnostic tests and possible treatments (Coordinateur). ANR (ANR-17-CE17-0010-01).

2017-19 : STARFISH DNA: Stalling the Replication Fork via the Impedimental Stabilization of Higher-order DNAs (Coordinateur). European Commission (H2020-MSCA-IF-2016-750368).

2015-16 : Des sondes fluorescentes intelligentes pour déchiffrer le mécanisme d’action in cellulo d’agents anti-cancéreux (Coordinateur). FEDER (PARI2-DS3-2015).

2010-13 : TuMOR TAG: Tumor-specific multi-operating radiotracers targeting telomerase and G-quadruplex (Coordinateur) ANR (ANR-10-JCJC-709-1).

2010 : Unusual DNA structures as novel targets for anticancer therapy (Coordinateur). Programmes Interdisciplinaires CNRS (PIR-AO2-2010).

2008-10: Development of molecular tools for imaging all types of cancers (Coordinateur). FABER (Conseil Régional de Bourgogne, FABER-2009-149E-149CE)

2019-21: ANASTOMOSIS: Alternative Nucleic Acid Structures as Targets for Organic Molecules to Orchestrate Sustained genomic Instability and cellular Stress (PI). Plan Cancer 2014-2020 INSERM.

2019-21 : CoolCat: Constrained oligonucleotide-based catalysts (CoI). ANR (ANR-18-CE07-0017-03).

2018-20 : DEMENTIA: Exploiting genetic biomarkers of neurodegenerative diseases for developing early diagnostic tests and possible treatments (PI). ANR (ANR-17-CE17-0010-01).

2017-19 : STARFISH DNA: Stalling the Replication Fork via the Impedimental Stabilization of Higher-order DNAs (PI). European Commission (H2020-MSCA-IF-2016-750368).

2015-16 : Des sondes fluorescentes intelligentes pour déchiffrer le mécanisme d’action in cellulo d’agents anti-cancéreux (PI). FEDER (PARI2-DS3-2015).

2010-13 : TuMOR TAG: Tumor-specific multi-operating radiotracers targeting telomerase and G-quadruplex (PI) ANR (ANR-10-JCJC-709-1).

2010 : Unusual DNA structures as novel targets for anticancer therapy (PI). Programmes Interdisciplinaires CNRS (PIR-AO2-2010).

2008-10 : Development of molecular tools for imaging all types of cancers (PI). FABER (Conseil Régional de Bourgogne, FABER-2009-149E-149CE)

Publications

>110 articles publiés : cf. liste

1 livre édité : Biological relevance & therapeutic applications of DNA- and RNA-quadruplexes (Ed. D. Monchaud) © 2015 Future Science, Ltd.

2 brevets : WO2010049915, WO2021198239

10 publications clés :

UV-induced G4 DNA structures recruit ZRF1 which prevents UV-induced senescence. Alessio De Magis, Michaela Limmer, Venkat Mudiyam, David Monchaud, Stefan Juranek, Katrin Paeschke. Nat. Commun. 2023, 14, 6705

Template-assembled synthetic G-quartets (TASQs): multiTASQing molecular tools for investigating DNA and RNA G-quadruplex biology. David Monchaud. Acc. Chem. Res. 2023, 56, 350

Click chemistry-based biomimetic ligands efficiently capture G-quadruplexes in vitroand help localize them at DNA damage sites in human cells, Francesco RotaSperti, Baptsite Dupouy, Jérémie Mitteaux, Angélique Pipier, Marc Pirrotta,Nicolas Chéron, Ibai E. Valverde, David Monchaud. JACS Au 2022, 2, 1588 

Interactions of small molecules with DNA junctions. Kane McQuaid, Angélique Pipier, Christine Cardin, David Monchaud. Nucleic Acids Res. 2022, 50, 12636

Global mapping of RNA G-quadruplexes (G4-RNAs) using G4RP-seq, Sunny Y. Yang, David Monchaud & Judy M. Y. Wong, Nat. Protoc. 2022, 17, 870

Identifying G-quadruplex-DNA–disrupting small molecules. J. Mitteaux, P. Lejault, F. Wojciechowski, A. Joubert, J. Boudon, N. Desbois, C. P. Gros, R. H. E. Hudson, J.-B. Boule, A. Granzhan, D. Monchaud. J. Am. Chem. Soc. 2021, 143, 12567

DNA junction ligands trigger DNA damage and are synthetic lethal with DNA repair inhibitors in cancer cells. K. Duskova, P. Lejault, E. Benchimol, R. Guillot,S. Britton, A. Granzhan, D. Monchaud J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 424

Applications of guanine-quartets in nanotechnology and chemical biology. L. Stefan, D. Monchaud Nat. Rev. Chem. 2019, 3, 650

Transcriptome-wide identification of transient RNA G-quadruplexes in human cells. S. Y. Yang, P. Lejault, S. Chevrier, R. Boidot, A. G. Robertson, J. M. Y. Wong, D. Monchaud Nat. Commun. 2018, 9, 4730

Thermophilic tetramolecular G-quadruplex/hemin DNAzyme. H. Ju, Y. Guo, J. Chen, M. Cheng, D. Monchaud, J. Zhou Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 16636

 

Shubham Sharma, Chinmayee Shukla, Jérémie Mitteaux, Angélique Pipier, Marc Pirrotta, et al.. G-quadruplex formation in long non-coding RNAs dysregulated in colorectal cancer. 2025. ⟨hal-05131642⟩
Leïla Dumas, Sauyeun Shin, Quentin Rigaud, Marie Cargnello, Beatriz Hernández-Suárez, et al.. RNA G-quadruplexes control mitochondria-localized mRNA translation and energy metabolism. Nature Communications, 2025, 16, pp.3292. ⟨10.1038/s41467-025-58118-5⟩. ⟨hal-05024071⟩
Shijiong Wei, Xiaobo Zhang, Yilong Feng, Shentong Tao, Dehui Qiu, et al.. Ultra-Specific G-Quadruplex–Colistin Interaction for Efficient Transcriptome-Wide G4 Mapping. Journal of the American Chemical Society, 2025, 147, pp.9962 - 9971. ⟨10.1021/jacs.5c01172⟩. ⟨hal-05018357⟩
Jiri Ledvinka, Francesco Rota Sperti, Gabor Paragi, Marc Pirrotta, Nicolas Chéron, et al.. Fluorescence Detection of DNA/RNA G‐Quadruplexes (G4s) by Twice‐as‐Smart Ligands. ChemMedChem, 2025, ⟨10.1002/cmdc.202400829⟩. ⟨hal-05018355⟩
David Monchaud, Angélique Pipier. Versatile Click Chemistry-based Approaches to Illuminate DNA and RNA G-Quadruplexes in Human Cells. Bio-protocol , 2025, 15 (3), pp.e5209. ⟨10.21769/bioprotoc.5209⟩. ⟨hal-04930089⟩
Maëlle Caroff, Aline Marnef, Angélique Pipier, Gaëlle Legube, Anton Granzhan, et al.. Ligand stabilization of DNA Three Way Junctions (TWJ) for targeted cancer therapy. Toulouse Onco Week, Feb 2025, Toulouse, France. ⟨hal-04930019⟩
Vijay Kumar M. J, Jeremie Mitteaux, Zi Wang, Ellery Wheeler, Nitin Tandon, et al.. Small molecule-based regulation of gene expression in human astrocytes switching on and off the G-quadruplex control systems. Journal of Biological Chemistry, 2025, 301 (1), pp.108040. ⟨10.1016/j.jbc.2024.108040⟩. ⟨hal-04870733⟩
Jérémie Mitteaux, David Monchaud. Protocol for cellular RNA G-quadruplex profiling using G4RP.v2. STAR Protocols, 2024, 5 (4), pp.103480. ⟨10.1016/j.xpro.2024.103480⟩. ⟨hal-04830486⟩
Giulia Nicoletto, Marianna Terreri, Ilaria Maurizio, Emanuela Ruggiero, Filippo M Cernilogar, et al.. G-quadruplexes in an SVA retrotransposon cause aberrant TAF1 gene expression in X-linked dystonia parkinsonism. Nucleic Acids Research, 2024, 52, pp.11571 - 11586. ⟨10.1093/nar/gkae797⟩. ⟨hal-04766424⟩
David Monchaud. Translating G-quadruplex ligands from bench to bedside: a Stephen Neidle's legacy. Medicinal Chemistry Research, In press, ⟨10.1007/s00044-024-03310-3⟩. ⟨hal-04692411⟩
Communications

>35 conférences invitées ; >40 posters

Articles de vulgarisation pour Medecine/Sciences, Journal du CNRS, Encylopaedia Universalis

Travaux repris dans CNRS News, CNRS, Science & Avenir et Pour La Science

Travaux recommandés par la « faculté des 1000 » en 2011, 2013 et 2018

Couvertures pour New J. Chem., Chem. Eur. J., Nucleic Acids Res., Eur. J. Org. Chem. et RSC Chem. Biol.

En interview dans l’émission CQFD de la RTS (Radio Télévision Suisse): ici

Enseignement et Administration

Enseignement

« Chimie & acides nucléiques » (2h/an, M2 MMHD, Dijon, depuis 2017).

« Chimie & cancérologie » (2h/an, M2R SCM, Dijon, depuis 2017).

« Chimie & recherche translationnelle en cancérologie » (4h/an, EPHE Dijon, depuis 2012).

 

Administration

>500 articles référés pour >80 journaux différents; cf. WoS profile

Jury pour Maître de Conférence : 32MCF4173 (ICMUB, Dijon, 2013), 32MCF0246 (ICMUB, Dijon, 2012), 85MCF1850 (Université Paris Descartes, Paris, 2010), 32MCF0255 (ICMUB, Dijon, 2010).

Jury pour HDR : R. Haudecoeur, DPM Grenoble, 2020; T. Caneque, Institut Curie, Paris, 2019; D. Gomez, IPBS Toulouse, 2017

Jury de thèse : Lab. D. Verga/JL. Mergny, IP Paris, 2023; Lab. S. Amrane, IECB Bordeaux 2022; Lab. T. Lavergne, UGA Grenoble, 2022, Lab. S. Ladame, Imperial College London (UK), 2021; Lab. C. Cruz Univ. Lisboa (PT) 2020; Lab. G. Salgado, IECB Bordeaux, 2019; Lab. O. Sénèque, CEA Grenobe, 2019; Lab. J.-L. Mergny, IECB Bordeaux, 2018 ; Lab. S. Richter, Unvi. Padova (IT), 2018; Lab. B. Therrien, Univ. Neuchatel (CH), 2018; Lab. M. Demeunynck, DPM Grenoble, 2016 ; Lab. J.-L. Mergny, IECB Bordeaux, 2016 ; Lab. F. Bolze, Strasbourg, 2015 ; Lab. R. Rodriguez, Gif/Yvette, 2015

Jury de Master 1 & 2 : ICMUB, Dijon, Juin 2021, 2020, 2012, 2013 & 2009 ; jury de M.Phil : Imperial College London (U.K.), Juin 2014.

Expert pour des agences de financement : European Research Council (ERC); Agence Nationale de la Recherche (ANR, France), Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC, UK), Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC, Canada), Genesis Oncology Trust (New Zealand), Czech Academy of Science (CAS, Czech Republic), CEFIPRA (France & India), European Science Foundation (ESF, France).